Martin Jakubíček vystudoval skladbu a cembalo na brněnské konzervatoři a své hudební vzdělání dále rozšířil studiem improvizace na JAMU, kterou záhy reprezentoval na varhanních soutěžích. Kromě sólové koncertní činnosti (cembalo, varhany, kladívkový klavír) působí jako umělecký vedoucí renomovaných komorních souborů zabývajících se stylovou interpretací renesanční a barokní hudby. Koncertuje ve většině evropských zemí, doma působí jako varhaník v brněnských kostelích, často doprovází pěvecké sbory, podílí se na nahrávkách desítek CD. Neméně důležitá je jeho činnost skladatelská a aranžérská.